Jennifer Anne Garner 1972. április 12-én született a Texas-állambeli Houstonban. Charlestonban és Nyugat-Virginiában nevelkedett két testvérével.

Ohioban szerzett színi diplomát 1996-ban, színházi szerepek után Los Angeles-be költözött ahol kisebb televíziós szerepek következtek.

Első igazi sikerét 2000-ben a Felicity című sorozat jelentette, ezután kérték fel az ABC új drámájának, az Alias-nak a főszerepére. Ez a sorozat hozta meg Jennifer számára az igazi áttörést, és rövid viszonyt is folytatott sorozatbéli partnerével, Michael Vartannal.

A sorozat sikere után egyre több filmszerep várt rá: Kapj el, ha tudsz!, Daredevil – A fenegyerek, Hirtelen 30 és az Elektra.

2000-ben házasságot kötött Scott Foley színésszel, azonban 2004 márciusában elváltak. Még ebben az évben Ben Affleck-kel kezdett randevúzgatni. 2005. június 29-én egybekeltek. Első közös gyermeküket pedig még ez év végére várják.